新疆與中亞五國應在農業科技領域展開全方位的合作，達到優勢互補，實現農業科技共同進步，藉此推動農業經濟的合作。
中國新疆與中亞五國在農業科技領域的合作具有很強的互補性。中亞五國都是以農牧業（種植業和畜牧業）為主要農業活動的傳統農業國家，具有較高的種植和畜牧技術。如中亞五國在棉花種植技術方面尤其是在棉花品種資源的歸類和儲存方面有一套較為完備的體系，在棉花生長研究、遺傳育種及栽培和灌溉制度等方面有較深的研究。新疆在棉花優質品種的改良升級與培育、優質棉花品種的推廣、棉花科學種植技術、棉花病蟲害防治、軋花工藝和棉紡技術等方面都有較明顯的優勢。
在水資源方面，中亞五國中除塔吉克斯坦和吉爾吉斯斯坦的地表水資源較豐富外，整個中亞地區降雨量較少且水資源貧乏，又屬內陸干旱區域。中亞五國農業節水灌溉面積都較少，對農業節水灌溉技術具有極強的需求。而新疆在地膜覆蓋技術和膜下滴灌技術方面具有較成熟的經驗和較高的技術水平，其技術水準已達到世界先進水平。
在農業機械化方面，中亞五國的農業機械化率普遍較低，農業生產力發展較滯后。而中國新疆農業機械化率和農業科技水平相比中亞國家較高。
新疆與中亞五國在農業科技領域已有成功的合作，如新疆天業集團自主研發的節水灌溉產品及技術已經走進中亞的哈薩克斯坦、烏茲別克斯坦和塔吉克斯坦，且已得到推廣并在塔吉克斯坦大面積的農作物種植地上應用，使其農作物單產產量提高2到3倍。新疆與中亞五國應在農業科技領域展開全方位的合作，達到優勢互補，實現農業科技共同進步，藉此推動農業經濟的合作。
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